Le but du stage de recherche est de permettre à l’étudiant d’acquérir un complément de formation à la recherche en sciences de l’activité physique, en travaillant avec une équipe distincte de son équipe de direction. Le thème du stage de recherche peut être relié à son domaine de recherche, mais ne peut porter sur son sujet spécifique.
Lors d'une insertion dans une équipe de recherche, l'étudiant développe des attitudes facilitant le travail en équipe et acquiert de nouvelles compétences en recherche. Le projet de stage doit être approuvé par le directeur de programme : il comporte 135 heures de travail incluant le rapport de stage à remettre à son directeur de recherche.