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Le Dr Agüero Bautista a obtenu la prestigieuse bourse Fulbright pour étudier aux États-Unis en 1994. Il a obtenu une maîtrise en linguistique appliquée de l'Arizona State University en 1996 et un doctorat en linguistique du Massachusetts Institute of Technology (MIT) en 2001. Noam Chomsky et Irene Heim faisaient partie des membres de son comité de thèse. Le Dr Agüero Bautista a travaillé comme sémanticien computationnel pour le Natural Language Processing Group de la Microsoft Corporation à Redmond, Seattle, avant d'effectuer des recherches postdoctorales à l'Université du Québec à Montréal (UQAM). Ses recherches postdoctorales se sont concentrées sur l'interaction des principes universels de l'économie et des principes du développement du langage dans des modèles biologiquement réalistes du langage humain (par exemple, le Programme Minimaliste). En 2007, il a été le principal organisateur de la conférence Biolinguistic Investigations, qui a eu lieu à Santo Domingo, en République dominicaine, et qui a été organisée en consultation avec Noam Chomsky et Massimo Piattelli Palmarini.
Le Dr Agüero Bautista s'est joint au corps professoral du Département de langues modernes et de traduction de l'Université du Québec à Trois-Rivières en 2010. Il est maintenant Directeur de programmes de la section des langues modernes du département.
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